实验室较为理想的布局模式为有一个专用走廊，试剂准备区、样品制备区、扩增区和产物分析区很规范地排列在一起，前三个区各有一个缓冲间，可供换工作服和工作鞋使用，顶上可装一紫外灯。内实验区域设为正压或常压状态，缓冲间内设为负压状态（可上设一抽风装置），使这三个区的空气流向为由实验区域内向外，缓冲间内通向内实验室和走廊的门可安装一种连锁装置，当一个门打开时，另一门必须处于关闭状态，防止出现两个门同时打开的情况。产物分析区可不设缓缓冲间，但应设为负压状态（装—个排风扇即可），使空气流向由外向内，以防止扩增产物的随空气流出。每一区域都须有明确的标记，工作按试剂准备区、样品制备区、扩增区至产物分析单—流向进行，各区的仪器设备包括工作服、鞋、实验记录本和笔等都必须专用。如果无法做到以上模式，以下基本要求必须做到：

（1）四个区域必须是相互独立的。  

（2）各区的仪器设备及各种物品必须是专用的。  

（3）各区完全独立，缓冲间可有可无。如为一个区套一个区的模式，区间不能直通，应有缓冲间，供换工作服及鞋子用，并保证两个区域间始终处于完全的分隔状态

（4）产物分析区应安装排风扇或其他抽风装置，维持负压。