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揭示果蝇 tsRNA 的作用机制
阅读次数:669发布时间:2018/3/15 10:30:02
来源于 tRNA 的 tsRNA 是近年新发现的一类小 RNA,研究发现 tsRNA 并非 tRNA 的随机降解产物,其与环境胁迫应答、细胞增殖和癌变、表观遗传等过程有关。先前研究表明 tsRNA 可以调控细胞的整体翻译水平,但是对其作用机制并没有统一的认识。
陆剑研究组首先通过对公共数据库中果蝇小 RNA 数据的分析,发现果蝇中大多数 tsRNA 是高度保守、普遍存在、并且有较高的丰度,揭示这些 tsRNA 可能有重要的生物学作用。结合 tsRNA 细胞转染、mRNA-seq、核糖体图谱(ribosome profiling)和双荧光素酶报告实验,他们发现 tsRNA 转染后能显著降低细胞的整体翻译水平,并且 tsRNA 通过进化上保守的互补序列来识别并抑制靶基因 mRNA 的翻译。他们靶基因预测结果显示 tsRNA 倾向于结合并抑制细胞翻译系统主要蛋白的 mRNA 分子,从而解释了 tsRNA 如何通过序列互补的模式来抑制细胞整体翻译水平。此外,对血清饥饿状态下的果蝇 S2 细胞的实验结果表明 tsRNA 参与了细胞的饥饿应答过程,并且这个过程是独立于 mTOR 通路,但是依赖于果蝇的 AGO2 蛋白。
(A) 果蝇 S2 细胞的实验处理和测序流程;(B) 果蝇细胞“tsRNA 连环计”的胁迫应答模型。
基于上述结果,该研究提出了果蝇细胞中“tsRNA 连环计”的胁迫应答模型。在胁迫条件下,生物体的细胞翻译水平通常会下调。在“tsRNA 连环计”模型中,首先 tsRNA 的生成会减少细胞中 tRNA 的丰度从而降低细胞整体翻译水平;其次 tsRNA 通过序列互补特异性抑制细胞翻译系统关键组分蛋白的 mRNA 自身翻译,从而降低细胞的整体翻译水平。基于 tsRNA 的连锁反应使得细胞能够迅速高效的产生胁迫应答。该研究首次揭示了果蝇中 tsRNA 介导的调控过程对细胞的能量平衡和代谢适应性的关键作用,对深入理解 tsRNA 的机制和功能提供了新的思路。
陆剑研究员为该论文的通讯作者。生科院博士后罗诗琦(现中国农业大学岗位科学家)、何峰(现浙江大学医学院讲师)、罗俊杰(现中国农业大学岗位科学家)、博士生窦圣乾、生命科学联合中心博士生王奕蓉是论文的共同作者,生命科学联合中心博士生郭安南为论文的共同作者。生科院研究生张宏同学亦对本研究提供了重要帮助。内华达大学的陈琦博士提供了建设性的意见。本研究得到了科技部、国家自然科学基金、青年千人计划科研启动经费、中国博士后基金和北大 - 清华生命科学联合中心的支持
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