近日，中国科学院昆明动物研究所基因调控与表观遗传学科组，以 CTCF prevents genomic instability by promoting homologous recombination directed DNA double-strand break repair 为题的论文，在线发表在 PNAS 上，研究揭示了绝缘子结合蛋白 CTCF 通过参与 DNA 损伤修复而帮助维持基因组稳定性。

CTCF 是控制染色质高级结构和表观遗传的关键蛋白，具有组织染色质高级结构、调控基因转录、作为绝缘子蛋白、参与遗传印记和参与选择性剪接等多种功能。CTCF 突变会引起人类小头畸形症和智力低下；条件敲除 CTCF，能够引发小鼠神经元缺失并阻断淋巴细胞的增殖和分化，增加肿瘤发生的机会；CTCF 可以帮助细胞抵抗凋亡和 UV 带来的伤害。针对这些现象，现有研究多从 CTCF 的绝缘子功能和基因表达调控层面进行解释，但科研人员认为这并不是 CTCF 在这些现象中直接的功能。许多 CTCF 缺失相关研究都有一个共同的，类似于影响基因组的稳定性的表型；CTCF 可能在维持基因组稳定性中有更为直接的功能。

为了寻找对这些现象简单的解释，科研人员研究了 CTCF 在维持基因组稳定性和 DNA 损伤修复中可能发挥的作用。研究发现，CTCF 缺陷细胞存在更多的染色质断裂、染色质末端融合。CTCF 敲低的细胞经过 DNA 损伤诱导药物处理或 UV 照射后会产生更多的γH2A.X 和 53BP1 颗粒（A，B），导致 DDR 关键因子 ATM 活化。激光损伤和 ChIP 实验发现，CTCF 可以被招募到 DNA 损伤区域，这一招募依赖于 ATM、NBS 和 CTCF DNA 结合域（C, D）。科研人员进一步使用针对 HR 和 NHEJ 设计的两个 DSB 诱导修复系统，证实 CTCF 的敲低会引起 HR 损伤修复效率降低。CTCF 与 HR 途径中关键因子 RAD51 有直接相互作用（E, F, G），CTCF 敲低影响 RAD51 的招募。研究人员推测，CTCF 和 RAD51 一起促进同源序列的识别，而增加 DNA 修复效率（H）。这表明 CTCF 确实参与了维持基因组稳定性和 DNA 损伤修复过程。这将引导科研人员对已发表的许多研究进行重新解释，也为科研人员从染色质高级结构组织层面研究基因组稳定性维持开启了新视角。