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窥探更细微基因变异
阅读次数:90发布时间:2017/4/17 12:21:13
单细胞研究是当前生命科学研究的重要方向之一。许多关键的生命活动都和细胞间个体差异密切相关;许多重要的生命科学和医学问题所能依赖的样品往往也是极少数细胞。但在相关研究中,由于单个细胞中的 DNA(脱氧核糖核酸)的含量极少,先需要通过全基因组扩增技术将 DNA 进行扩增,从而便于单细胞测序。
新单细胞扩增技术名为 LIANTI,由美国科学院院士谢晓亮教授领导的研究团队经 4 年努力研发而成。谢晓亮同时在哈佛大学和北京大学任职。他告诉记者,跟以往的技术相比,新技术在所有指标上都有大幅度提高,让单细胞扩增与测序更加精准。
首先,单细胞基因组经 LIANTI 技术放大后,“噪音”非常小,这使测量基因拷贝数的精确度非常高。拷贝数是指某基因在基因组中的个数。人的体细胞内基因拷贝数一般是两个, 分别来自父母,但在癌症中基因拷贝数有可能变多或变少,在遗传疾病中甚至有时缺失。许多癌症和遗传病都与拷贝数变异有关。
谢晓亮说,新技术使得测量拷贝数的空间分辨率提高了 3 个数量级,由此能查出基因组上以前查不出来的一些小段碱基微缺失。这意味着能更有效、更精准地检测出更多遗传疾病。
其次,测单碱基突变的灵敏度大大增强。单碱基突变是指基因组上只有一个碱基突变,它同样有可能导致癌症与遗传病。
第三,新技术测量基因组的覆盖率达到 97%。也就是说,一个细胞基因组里 97%的碱基可以测到。
谢晓亮说,LIANTI 技术跟 PCR(聚合酶链反应)技术类似,但不同的是,前者放大的不是单个基因,而是整个基因组。与 PCR 技术的指数放大方法相比,LIANTI 技术的线性放大方法减少了“噪音”与错误。PCR 技术是上世纪 80 年代发展起来的,其发明人因此获得 1993 年诺贝尔化学奖。
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